Anche durante il GP del Giappone, la FIA ha dovuto analizzare diverse situazioni presentatesi nel corso delle qualifiche. La commissione ha dato maggior importanza ai tempi ottenuti con le bandiere gialle da Kobayashi, Grosjean e Perez. Per questi tre piloti non ci sono state nessune penalità. L'idolo di casa, Kamui Kobayashi, è stato graziato: il giapponese ha dimostrato con i sui dati telemetrici di aver "alzato il piede" rispetto ai giri precedenti nel tratto dove erano esposte le bandiere gialle.Altro pilota sotto inchiesta è stato Sebastian Vettel accusato di aver ostacolato Fernando Alonso alla chicane. La FIA ha deciso di non dare nessuna penalità al tedesco ma non è mancato il richiamo. In effetti la Red Bull è rimasta sulla sinistra nella frenata alla chicane disturbando la staccata di Alonso ma poi il campione del mondo ha lasciato la traiettoria alla F2012 in curva.Diversa è stata la decisione nei confronti di Vergne: il francese della Toro Rosso domani partirà 3 posizioni indietro per aver ostacolato Bruno Senna durante la Q1. Jean-Eric Vergne ha dichiarato: "Ho visto Bruno arrivare molto velocemente e sapevo di doverlo lasciar passare, ma sfortunatamente mi ha raggiunto proprio in corrispondenza della chicane. Ho cercato di mettermi più esterno possibile, ma non c'è molto spazio e lui è stato costretto a rallentare parecchio".Per il momento, questa sanzione si aggiunge a quelle stabilite prima delle prove. Michael Schumacher perderà 10 posizioni sulla griglia, in seguito all'incidente con Vergne durante il Gran Premio di Singapore. L'inglese della McLaren perderà 5 posizioni per aver sostituito il cambio per evitare il problema avuto da Hamilton nello scorso gran premio. Stessa penalità per Nico Hulkenberg anche in questo per essere intervenuti sulla trasmissione, danneggiata nell'incidente del mattino.Charles Pic è stato ammonito, mentre il suo team ha dovuto pagare 5.000 euro per aver ostacolato Hamilton durante le prove libere. La colpa è della Marussia perchè non ha avvisato il pilota dell'arrivo della McLaren.